Zabieg poprzedzony jest badaniami, konsultacją urologiczną w Warszawie oraz wypełnieniem niezbędnych formularzy, w tym formularza zgody na przeprowadzenie wazektomii. Nie jest wymagane wcześniejsze, specjalne przygotowanie, natomiast zaleca się usunięcie owłosienia z obszaru moszny. Zabieg przeprowadza się w znieczuleniu miejscowym i może trwać on od kilkunastu go kilkudziesięciu minut, w zależności od zakresu działań.
Wspominaliśmy, że wazektomia nazywana jest także „podwiązaniem nasieniowodów” i jest to najczęściej wykorzystywany sposób, przy czym przez podwiązanie rozumie się przecięcie nasieniowodów, a następnie zablokowanie ich z jednej strony za pomocą podwiązki, klipsów bądź metodą koagulacji, co skutecznie blokuje przepływ plemników. Inną, rzadziej stosowaną techniką, jest tzw. totalna wazektomia, gdzie usuwany jest fragment nasieniowodów.
Wracając do przebiegu zabiegu – obszar zabiegowy jest dezynfekowany, po czym specjalista lokalizuje nasieniowód i dokonuje niewielkiego nacięcia w mosznie, dostając się do niego. Następnie rozwarstwia skórę w okolicy nasieniowodów, co ułatwia ich uwidocznienie i zablokowanie, przy pomocy obranej, ustalonej wcześniej z Pacjentem metody.
Bezpośrednio po zabiegu pacjent może wrócić do domu. Zaleca się wstrzymanie się od współżycia przez kilka dni po zabiegu oraz unikanie kąpieli w wannie w tym czasie. W przypadku bólu po zabiegu można sięgnąć po dostępne środki przeciwbólowe. Pozostawiona blizna, po zagojeniu jest niemal niewidoczna.